合作碳源是可為污（廢）水生化處理系統的微生物生長代謝提供營養(yǎng)物的含碳元素化合物。碳源分為單一碳源和復合碳源，單一碳源是只含有一種有效碳源成分的碳源。復合碳源是由兩種或兩種以上的有效碳源成分組成、有效碳源成分之間須兼容且無化學反應、不存在風險的碳源。 碳源有效成分為具有單一分子式和分子結構的、且易被微生物利用的有機化合物，包括甲醇、乙醇、丙醇、丁醇、乙二醇、丙三醇、丁醇、戊醇等小分子醇類，甲酸、乙酸、丙酸、乳酸、丁酸、乙酸鹽、檸檬酸、檸檬酸鹽等小分子有機酸和有機酸鹽類，葡萄糖、果糖、蔗糖等糖類物質。規(guī)定有效碳源成分需符合相應的 或者行業(yè)標準的要求。

合作碳源在當下的工業(yè)生產當中應用非常廣泛。糖類是較好的碳源尤其是單糖(葡萄糖果糖)雙糖(蔗糖麥芽糖乳糖)絕大多數微生物都能利用.此外簡單的有機酸氨基酸醇醛酚等含碳化合物也能被許多微生物利用。 所以我們在制作培養(yǎng)基時常加入葡萄糖蔗糖作為碳源.淀粉果膠纖維素等這些有機物質在細胞內分解代謝提供小分子碳架外還產生能量供合成代謝需要的能量所以部分碳源物質既是碳源物質同時又是能源物質。 在微生物發(fā)酵工業(yè)中常根據不同微生物的需要利用各種農副產品如玉米粉米糠麥麩馬鈴薯甘薯以及各種野生植物的淀粉作為微生物生產廉價的碳源.這類碳源往往包含了幾種營養(yǎng)要素。